Category: медицина

Category was added automatically. Read all entries about "медицина".

Many people are stopping being alive

Это настолько невыносимо прекрасно, что пройти мимо невозможно.

Ketan Joshi, твиттер [profile] ketanj0, описывает себя как "Climate and clean tech author and analyst" и пишет в твите:

Can you imagine if media outlets reported on pandemics the same way they reported on climate-caused disasters?



Здорово? Прям в яблочко попал. 6 декабря 2019 года.

6 декабря 2019 года, когда ещё даже жителя Уханя не знали, с чем столкнулись.

Как же он прав и про пандемию, и про изменение климата. Всего-то надо мозги включать... Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/98211.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

"Danish mask study"

Этот год доставляет мне какое-то нескончаемое бомболейо относительно использования статистики и тервера медиками. Вот только вчера отбомбило про более-менее трудное "отсутствие доказательств не есть есть доказательство отсутствия" (и, да, признаю, что конкретно в том контексте это действительно скорее придирка вызванная топтанием по больной мозоли), как сегодня Талеб чётко сформулировал всего лишь несколько соображений про недавно опубликованную странную работу, уже весьма известную как "Danish mask study".

Работа, напомню показала, что по мнению авторов, ношение масок хоть и несколько улучшает прогноз по заражаемости, но крайне слабо, статистически не значимо (2.1% vs 1.8%, или 42/2392 vs. 53/2470, проверяли по титрам антител), что как бе по их мнению намекает, что маски не особо-то работают. Тут, как бе, сразу уже возникает интерес are you okhreneli tam? как это им так удалось сдизайнить стади, показавшее столь выдающееся низкую эффективность масок, однако дело оказалось даже не в дизайне (или точнее - совсем не только в дизайне).

Оказывается чуваки в белых халатах на модных табуреточках доказательной медицины зафакапили чуть более чем всю интерпретацию полученных результатов.

Конкретно, как минимум, они продолбали:

- сильный статистический сигнал в виде результатов PCR тестов (0 против 5) и клинической диагностики (5 против 10)
---- вероятность получить 0 реализаций из 2392 попыток в схеме бернулли со средним 5/2470 составляет 0,79% (нужна поправка на FPR****)
---- аналогичное по PCR+клинике даёт вообще 0,38% (нужна поправка на FPR****) - оба этих сигнала остались авторами не замеченными.

- путают условные и полные вероятности, не учитывая, что серьёзная доля инфицирований при локдауне - внутридомовые, где масок не носят; и вообще стади маски против без_масок вне домов проводилось в условиях, когда главные super-spreader events невозможны - рестораны, бары и прочие кафе были закрыты на карантин, т.е. ну как бы самый не реалистичный юзкейс.

- и самая мякотка - они вообще не учитывали характеристики ошибок тестов на антитела. И это при том, что сигнал у них находится в самых хвостах распределений - 2% они выявили инфицированных, а о том, сколько среди них фальш-положительных они не подумали. Вот Талеб показывает, если тест даёт 1% фальшивоположительных (стади собирало данные по самое начало июня, какие характеристики тесты имели в то время, вопрос открытый. Современный тест на IgG к нуклеокапсидному белку, которые делает, например, Инвитро, по их утверждениям** имеет специфичность 99.6%, т.е. 0.4% фальшположительных - не 1%, да, но это современный тест. Например, вот тут от сентября со ссылкой на кохрейн в качестве специфичности используют 98,7%, т.е. фпр уже 1,3%), то получаем следующий расклад:

Для масок: (42(по антителам) - (1%FPR от 2392 масочников) + 5 (PCR+клинические))/2392 = 0,96%
Без масок: (48 (по а/т) - (1%FPR от 2470 без_масок) + 15 (PCR+клиника))/2470 = 1,55%

Тут правда я не знаю, можно делать +5/+15, т.к. они уже могут быть учтены в цифрах по антителам, но это надо как минимум лезть в папир, а то и в сырые данные.

Ну и да, вычитать ещё home infections, что сделает разницу ещё острее.


Короче, блин, это стади просто номинация на премию Дарвина на "факап года", ибо правильная интерпретация данных просто переворачивает вывод с головы на ноги.

Это, блин, десять лет расстрелов на помойке без права переписки с последующей сдачей в рабство на мехмат мыть сортиры...

--------------

** - я лично писал им в суппорт вопрос о характеристиках их IgG теста. "Чувствительность теста 100% и специфичность к вирусу 99,6%" - это дословный ответ. Однако, тот же сборник на bmj со ссылкой на кохрейн пишет следующее: "For IgG alone the maximum sensitivity was 88.2% at days 15-21 after symptom onset.". Поэтому что-то мне внезапно стало очень интересно, чтож такого волшебного произошло с -сентрября, что чувствительность/специфичность так скаканули? Или традиционно - просто наврали?
UPD: не, не наврали, см тут раздел Abbott Architect SARS-CoV-2 IgG (Инвитра говорит, что они его используют). Действительно чувствительность 100%, но 95%CI (95.8%; 100%) и действительно специфичность 99.6%, но 95%CI (99.0%; 99.9%).
Так что Талебовские 1% даже сегодня вполне правдоподобны.

**** - FPR для RT-PCR составляет 5%, что для 5 положительных вроде как пренебрежимо.
И да, по PCR они не всех тестировали, а вроде как 124 против 140, если я правильно понял. Тогда я нифига-не-пони, как они на 124 людях при 5% ФПР получили 0 положительных. вопросы-вопросики...
Короче, тут, конечно, прежде чем делать окончательные выводы, надо сначала всё разобрать до атомов, и это правильно, но это всё равно как-то не хорошо пахнет. Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/97866.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

Про то, как правильно использовать "всё взаимосвязано"

Биржевикам должно особенно понравится - определяем начало эпидемии по прорыву уровня поддержки (речь идёт о пользовательских отзывах на Амазоне об ароматизированных свечах, есичо):



Источник
. Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/97706.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

"Шведский эксперимент"

Sweden fuck-up

Нельзя не сказать, что умным людям©®™ было с самого начала понятно, что они там восторженные идиоты в стране эльфов. Удивительно лишь, что ждать пришлось несколько дольше ожидаемого. Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/97297.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

Про роль личности в истории

Очень поучительный тред как Jeremy Howard, обычный дата-саентист, сумел запустить движение #Masks4All и в конечном счёте умудрился таки добить дуболомов из CDC и WHO до рекомендаций использования масок для защиты органов дыхания во время эпидемии респираторного заболевания.

https://threadreaderapp.com/thread/1283505175206916096.html

Тред ценен не только и не столько иллюстрацией субжевого концепта, сколько высвечиванием неумения и нежелания всех властей работать головой, и трудностей делания науки даже в таком просвещённом 21 веке.

One of the really amazing things after my article came out is that scientists started writing to me and sending me their unpublished research about masks. It turns out that many people weren't able to discuss community mask use at that time, because it was against CDC guidelines
Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/97161.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

Повысить эффективность масок

https://www.nature.com/articles/srep39956

Ещё в январе 2017 корейцы проверили на мышах и обычных гриппах, SARS, MERS и H1N1 swine flu идею, что предварительная обработка защитных масок и прочих СИЗ дыхания раствором обычной поваренной соли (NaCl) + ПАВ существенно улучшает их противовирусную работу за счёт как улучшения фильтрации, так и за счёт инактивации попавших в фильтр вирионов.
(Кстати, кто не помнит, в Корее и в США вспышка ковида началась примерно в одно время, но в Корее с их повальным использованием масок, на сегодня только 291 погибший при огромной плотности населения в городах)

https://www.ajicjournal.org/article/S0196-6553(20)30318-7/pdf

наследная работа, написанная апр2020 (опубликована 25мая https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0196655320303187) уже по Ковиду (точнее, частицам сравнимого с ним размера).

Results:In this study, we found that paper towels and surgical masks pretreated with the salt-based solution showed a noticeable increase infiltration of nanoparticles similar in size to the COVID-19 virus. We also show that the TWEEN20 used by Quan et al. is not a critical component for the solution, and using salt alone in solution still provides a dramatically increased level of protection.

Кратко - всё относится и к ковиду, ПАВ для приготовления раствора не обязателен (хотя желателен, наверное можно каплю условного "фейри"). Достаточно раствора 30г соли в 100г дейонизированной воды. Обрабатывается/пропитывается бумажное полотенце, которое будет работать как фильтр в самодельной маске, либо средним слоем под хирургической маской (внутренний слой просто ткань для убирания прямого контакта просолённого фильтра с кожей), либо внешним слоем над N95.

ps: даже огромные 50 микронные частицы прекрасно летают и держатся в воздухе https://twitter.com/MicroLevitator/status/1283556047471378432 Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/96889.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

Про раннее определение всплесков эпидемии, - продолжение

В продолжение ранее затронутой темы раннего до-медицинского определения новых массовых случаев заболевания Covid-19 подъехал свежий массивный папир arXiv:2007.00756 An Early Warning Approach to Monitor COVID-19 Activity with Multiple Digital Traces in Near Real-Time от команды аж 17 учёных и медиков из госпиталя Бостона, университетов Гарварда, Мэриленда, Стенсфорда, Зальцбурга, Гамбурга и т.д. и т.п. Комбинируя данные множества информационных потоков (тренды Гугла, Твиттера, аномалии данных сети smart термометров и т.д. и т.п.) получили предиктор, определяющий прорывы (по Штатам) за 2-3 недели до определения обычными эпидемиологическими-медицинскими  методами.

Естественно, если я правильно понял, пока результаты проверены только бэктестом, что даже для такой понятной и чётко коррелируемой области, как прорыв известной эпидемии, всё равно не совсем надёжно, хотя бы в силу нестационарности данных - люди становятся всё более информированны по вопросу и всё более привычны к нему, поэтому это может уменьшать реальный цифровой отпечаток событий. Собсно, сейчас по некоторым ковидным тематикам яндекс показывает уменьшение числа запросов - это потому, что действительно меньше случаев стало, или просто люди уже всё и так знают и меньше лезут в интернет за информацией?

Но в целом всё равно интересно и скорее будет работать, как задумано. Здорово! Интересно, когда раскатят на реальную работу?

Что вам ещё надо знать?



За репост этой карикатуры Ёлкина Лабинский районный суд Краснодарского Края в лице судьи гр. Лебенко Н.М., при секретаре гр. Костомаровой Н.Н. оштрафовал краснодарца И.С.Юркова на 30000 рублей, усмотрев в размещении им оной картинки в своём Instagram на 90 подписчиков, цитирую:

...распространение в информационно телекоммуникационной сети «Интернет» информации, выражающей в неприличной форме, которая оскорбляет человеческое достоинство и общественную нравственность, явное неуважение к обществу, государству, органам, осуществляющим государственную власть в Российской Федерации...


Я, конечно, знаком с заявлением Госдепа США о закупке ряда изделий медицинского назначения, таких как аппараты исскуственной вентилляции лёгких, медицинские маски, иные СИЗ и т.д. и т.п., в России (вот ABCnews подробно с цифрами количества купленного и стоимостей и прочими подробностями рассказывает; вот на BBC по русски). Но нам же не зря с утра до вечера твердят умные люди о том, что все там за бугром только и думаю о том, какую бы ещё гадость про нас тут придумать и как ещё нас обмануть. Поэтому я не очень уверен в правдивости этих сообщений, вдруг это как раз тот случай? Зачем продавать на сторону важнейшие и нужнейшие медицинские изделия, когда в твоей стране на носу сильнейшая и, вероятно, опаснейшая за последние 100 лет эпидемия?

Но мне вот не понятно, как изображение соотносится с инкриминируемым деянием? Ну какие-то два мужика, ну и что с того? Какая связь то? Так и в узоре облаков можно прочитать оскорбления, и в шуме листвы.
А если оскорбление и действительно было, то разве не требуется сначала доказать его какое-то вредоносное влияние и факт законченности? Так же можно любой взгляд посчитать за неодобрительный и оскорбительный, а значит подлежащий скорейшему пресечению любыми методами? И что мы тогда получим?

Что думают мои читатели? Может быть вы перепостите и среди ваших читателей найдутся знатоки, способные разъяснить казус? Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/95235.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

WHO, ВОЗ

Хороший тредик с опруфованым подмечанием "интересного" поведения т.н. Всемирной Организации Здравоохранения.

https://twitter.com/yujiechentw/status/1247903128038469633

С одной стороны автор может быть заинтересованной стороной, - она из Тайваня, - но с другой стороны факты есть факты.

Про факап с нерекомендацией масок там еще, кстати, не упоминается, а это должно быть вообще отдельной строчкой приговора этим продажным гавнюкам.

Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/95116.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.

Про количество заболевших Covid-19 в РФ... хммм...

В NYT тут вышла любопытная статья, напоминающая, что огромное множество повторяющихся событий, происходящих в обществе, находит своё отражение в статистике поисковых запросов. Причём связь настолько сильная, что в некоторых случаях есть хорошие шансы опознать наступление события (эпидемии, например) ещё до того, как это будет признано другими способами.

В статье рассматриваются поисковые запросы, относящиеся, очевидно к нынешней пандемии, и делаются кое-какие интересные выводы насчёт реального положения дел, в частности, в Эквадоре.

И мне, разумеется, стало интересно, а что же можно увидеть в статистиках соответствующих запросов на русском языке? Поскольку официальные данные нам твердят, что распространение заболевания началось вот только-только, но кто ж верит официальным данным в стране с такой героической историей вранья? А вот статистика поисковых запросов - дело другое. Очень трудно поверить в то, что и Яндекс и Гугл будут её подделывать (даже забывая про глупость теорий заговоров с большим числом участников, эти статистики - прежде всего очень важный инструмент для работы рекламы - основного их источника дохода).

И вот что получилось: забив на вскидку основные релевантные запросы (напр: резь в глазах, боль в глазах, потеря запаха, перестал чувствовать запах, не чувствую запахи, исчезли запахи и т.д.) в трендс/вордстат, статса и там, и там, показывает, что их лавинное нарастание действительно приходится только на последний месяц (причём в большинстве случаев через Яндекс это видно гораздо лучше, чем через Гугл, - ну это уже вопрос про популярность поисковиков).

У этого я вижу два объяснения, первое из которых мне видится сильно менее вероятным:

1. либо предполагаемый прорыв эпидемии произошёл в областях страны, где люди "менее склонны" спрашивать поисковики о своих проблемах (например, где пользователей Интернета мало и Интернет там вообще недавно), - но это, повторюсь, выглядит крайне маловероятным по множеству причин.

2. либо официальные данные развития эпидемии (пусть и с каким-то коэффициентом пропорциональности) вполне верно отражают текущее положение дел.

А раз так, то это скорее плохие новости. Потому раз теперь предположение, что эпидемия началась гораздо раньше, стало невалидным, то автоматически невалидными стали надежды, что многие уже могли так или иначе переболеть и получить иммунитет.

А раз так - пристегните ремни надевайте маски! Самая жопа ещё действительно впереди.

PS: аналогия ремни-маски взята не случайно! Вы же не дожидаетесь начала аварийной ситуации, чтобы начать пристёгиваться, верно? Верно же? Вот не надо ждать появления симптомов болезни! От 30% до 50% (есть даже утверждения вроде 4 из 5, но там много вопросов к методологии и соответственно выводам) людей переносят Covid без симптомов вообще, а у тех, у кого разовьются симптомы - это произойдёт в 50% случаев более, чем через 5 дней после инфицирования (вплоть до 2х недель!)
Все они при этом эффективно заражают окружающих, т.к. вирус в первую очередь передаётся воздушно-капельным путём. Ваша маска (даже простая самодельная!) помогает как вам, уменьшая поступление "инфицированной" пыли и капелек жидкости из воздуха в дыхательные пути, так и окружающим, погашая возможное распространение вируса вами.

https://masks4all.co/

UPD3: ещё из свежего исследование и популярное описание. Оригинал записи тут: https://arech.dreamwidth.org/94844.html. Коментить лучше там (OpenID работает), но можно пока и тут.